Ein weiteres Anwendungsgebiet für Polyimidfolien sind Brennstoffzellen.
Eine Brennstoffzelle ist eine elektrochemische Zelle, die die chemische Energie eines Brennstoffs (oft Wasserstoff) und eines Oxidationsmittels (oft Sauerstoff) durch ein Paar von Redoxreaktionen in Elektrizität umwandelt. Brennstoffzellen unterscheiden sich von den meisten Batterien dadurch, dass sie zur Aufrechterhaltung der chemischen Reaktion eine kontinuierliche Quelle von Brennstoff und Sauerstoff (in der Regel aus der Luft) benötigen, während in einer Batterie die chemische Energie in der Regel aus Metallen und deren Ionen oder Oxiden stammt, die in der Regel bereits in der Batterie vorhanden sind, außer bei Durchflussbatterien. Brennstoffzellen können so lange kontinuierlich Strom erzeugen, wie Brennstoff und Sauerstoff zugeführt werden.
Das Eigenschaftprofil der Polyimidfolie ist geeignet für Dichtungen und als Membran-Rahmen in diesen Anwendungen.